Il existe deux grandes catégories de modalités de financement alignées sur les systèmes nationaux : i) l’appui budgétaire et ii) l’aide budgétisée (également connue sous le nom d'appui budgétaire réservé).

Les modalités de financement alignées suivent essentiellement les mêmes règles, outils, responsabilités et nécessité de rendre compte que celles utilisées pour la mise en oeuvre du budget national et du financement intérieur du pays. Cet alignement sur les systèmes nationaux permet toutefois une flexibilité et une adaptation considérables aux divers contextes, ainsi qu'à la volonté des partenaires de développement de gérer les opportunités et les risques.